Modele anatomiczne czaszki odgrywają kluczową funkcję w edukacji medycznej, badaniach naukowych również w praktyce medycznej. Ich znaczenie pochodzi z konieczności dokładnego poznania budowy czaszki, która jest jednym spośród niezwykle skomplikowanych elementów ludzkiego szkieletu. Modele anatomiczne pozwalają one na dokładne przestudiowanie układu kostnego, wzajemnych zależności pomiędzy poszczególnymi składnikami czaszki również na łatwiejsze zrozumienie mechanizmów urazów, deformacji i wady. Modele anatomiczne czaszki są również szeroko używane w stomatologii. Budowa czaszki ma fundamentalne znaczenie w diagnostyce i pomaganiu schorzeń jamy ustnej, wad zgryzu czy problemów ortodontycznych. W ortodoncji modele anatomiczne czaszki pomagają w analizie struktury żuchwy i szczęki, co gwarantuje dokładne zaplanowanie leczenia aparatami ortodontycznymi. Nie bez znaczenia są również modele anatomiczne czaszki w medycynie sądowej i antropologii. Modele anatomiczne czaszki, które różnią się stopniem dokładności oraz materiałem wytworzenia. Jednym spośród najbardziej ważnych typów są standardowe modele anatomiczne czaszki ludzkiej, przedstawiające główne kości oraz ich związania. Modele anatomiczne tego rodzaju są często używane w edukacji i służą do nauki podstawowej anatomii czaszki. Inną wersję stanowią modele anatomiczne czaszki z ruchomymi elementami, które gwarantują na łatwiejsze zrozumienie połączeń pomiędzy kośćmi oraz procesów ich ruchu, co jest zwłaszcza pożądane w stomatologii i chirurgii szczękowej.
W niezwykle rozwinięte modele anatomiczne czaszki mogą być rozkładane na pojedyncze kości, co umożliwia na dokładne zbadanie jedynych elementów. Dzięki temuż można zauważyć, w jaki sposób poszczególne kości są ze sobą powiązane, które mają kształty oraz które struktury anatomiczne się na nich znajdują. Tego rodzaju modele anatomiczne są niezwykle przydatne w nauce anatomii i chirurgii, ponieważ dają wnikliwą analizę struktur trudnych do zaobserwowania w rzeczywistej czaszce. Drugim typem są modele anatomiczne czaszki z zaznaczonymi strukturami anatomicznymi, które pomagają w edukacji szczegółowej anatomii. W takich modelach nowe elementy czaszki są oznaczone barwami, co ułatwia ich identyfikację. Na przykład kości tworzące podstawę czaszki mogą być podkreślone różnym odcieniem niż kości sklepienia, a kanały nerwowe i otwory mogą być wyróżnione w sposób ułatwiający ich zapamiętanie. Jest to zwłaszcza korzystne dla studentów medycyny, którzy muszą pokonać skomplikowaną terminologię anatomiczną. Dla bardziej zaawansowanych użytkowników dostępne są modele anatomiczne czaszki z odwzorowanymi strukturami nerwowymi i naczyniowymi. Tego rodzaju modele anatomiczne posiadają przebieg nerwów czaszkowych oraz naczyń krwionośnych, co jest niezmiernie istotne w nauce neuroanatomii i neurochirurgii. Dzięki nim można prześledzić ścieżki przebiegu nerwów, ich położenie względem struktur kostnych i miejsca, w których mogą być one uciskane lub uszkadzane. Współczesna metoda pozwala też na tworzenie modeli czaszki w technice druku 3D. Modele anatomiczne te mogą być wykonywane na bazie prawdziwych danych tomograficznych, co umożliwia na odwzorowanie indywidualnych cech anatomicznych pacjenta. Takie modele anatomiczne są wyjątkowo przydatne w planowaniu operacji chirurgicznych, ponieważ dają lekarzom wcześniejsze przećwiczenie technologii na określonym odwzorowaniu czaszki pacjenta. Metoda ta jest też wykorzystywana w rekonstrukcji buzi w przypadkach urazów oraz deformacji wrodzonych.